金槍魚及一些名貴魚類由于肉中含有大量脂肪，在常溫下保存會出現脂肪自溶及氧化現象，尤其是金槍魚，魚肉還富含肌紅蛋白，因而肉色鮮紅，然而由于個體較大，影響其肌肉的冷卻速度和凍結速度，極易造成肌肉變色，一般來說，金槍魚的適當保存期限以高鐵氧合肌紅蛋白的生成率達20%為界限，因而保存方法極為重要。
目前，金槍魚合理且常用的保存方法主要有兩種：
1、冰鮮法：魚身覆蓋碎冰，保存溫度：-2～-4℃，保存期限7-14天
2、凍結法：超低溫環境保存，
保存溫度：-20℃，保存期限7-14天;
保存溫度：-40℃，保存期限30-60天
保存溫度：-60℃，保存期限6-12個月
保存溫度：-80℃，保存期限＞24個月
海釣金槍魚，釣到金槍魚經過放血、清理后一般會先放入冰窖冰鮮保存，到岸后通過碎冰保存的方法運輸到目的地，整個過程一般會在3-4天；金槍魚運回后會馬上放入
超低溫冰箱降溫保存。